le projet
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Les lycée sélectionnés sur dossier travaillent sur deux projets :
Si votre sujet de TiPE vous permet de vous insérer dans ce programme, vous aurez accès aux fournitures et matériel pour extraire l'ADN, amplifier des séquences par PCR, faire une électrophorèse, et envoyer de l'ADN amplifié à séquencer. En contrepartie, vous devez partager les séquences obtenues dans une base de données commune, et vous devrez aussi faire de la communication autour de votre TiPE en mentionnant le terme «Génome à l'école» et le partenaire INRA (un article pour le site web du lycée, inviter la presse, etc. Pour cela, contacter la responsable de la communication du lycée Charlotte AUDOUIN)
- un projet pilote : le projet "populus" qui a pour but l'étude du peuplier noir en partenariat avec l’INRA d’Orléans (Unité Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières)
- un projet propre à leur établissement : Pommes et poires pour Angers
Si votre sujet de TiPE vous permet de vous insérer dans ce programme, vous aurez accès aux fournitures et matériel pour extraire l'ADN, amplifier des séquences par PCR, faire une électrophorèse, et envoyer de l'ADN amplifié à séquencer. En contrepartie, vous devez partager les séquences obtenues dans une base de données commune, et vous devrez aussi faire de la communication autour de votre TiPE en mentionnant le terme «Génome à l'école» et le partenaire INRA (un article pour le site web du lycée, inviter la presse, etc. Pour cela, contacter la responsable de la communication du lycée Charlotte AUDOUIN)
Peuplier noir«Le peuplier noir a été choisi car c'est le premier arbre qui a été séquencé et qui fait l'objet d'un vaste programme de génétique moléculaire (lié à l'étude de caractères du bois et de résistance aux maladies), conduit par le centre Inra Val de Loire, site d'Orléans (UAGPF) et l'INRA d'Evry (URGV). Depuis 20 ans, cette espèce fait l'objet d'un programme de conservation de ressources génétiques; Aujourd'hui le site d'Orléans et le Pôle National des Ressources Génétiques Forestières de Guémené-Penfao disposent de nombreuses ressources génétiques identifiées et géolocalisées sur les différents fleuves et rivières français.»
Dans le cadre du projet «Populus», le lycée a une pépinière de 80 boutures provenant de 30 peupliers noirs , avec 6 répétitions. 5 sont 33localisés dans la Région, 15 proviennent d'autres régions et 5 sont des peupliers d'une autre espèce que le peuplier noir.
Correspondant INRA Peuplier Noir à Orléans : Marc Villar
«Le peuplier noir, grâce à sa facilité de multiplication végétative et à sa croissance très rapide (jusqu’à 15 cm de hauteur par semaine ! ), peut être le support d’expérimentation simple. En plantant des peupliers noirs , il est possible d'illustrer aisément les notions de diversité génétique soit entre espèces ou soit à l'intérieur de la même espèce (notion de diversité génétique intraspécifique).» Le lycée a une plantation de boutures provenant de peupliers noirs géolocalisés de la Région.
«Ces comparaisons peuvent être réalisées par des observations simples (croissance de la tige, de la feuille, phénologie, forme, etc.). Cette expérimentation peut être également le support d’expériences simples : croissance de la tige (en fonction de la température), évolution de la surface de la feuille, mesure d’angle de branches, etc.» En place, au printemps, on peut mesurer la date de floraison. Une banque de données provenant d'une vingtaine de lycées donne accès au génotype de peupliers noirs de toute la France (mais pas de données sur le phénotype, il faut établir une collaboration avec d'autres lycées). Vous devrez vous même alimenter cette banque, avec un étiquetage très rigoureux. documentationCe ne sont que querques articles, poursuivez vos recherches sur Pubmed
Généralités
Implantation sur berges & reproduction
Hybridation & phylogénie
sécheresse & température
phénotype
Pathogènes & insectes
biodiversité
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Pommes & poiresRessources végétalesLe lycée dispose de boutures 22 variétés greffées de poires et pommes* ( en changeant les couples greffon et porte greffe), avec 2 répétitions, en 3 haies. *Il y a plus de poiriers que de pommiers.
L'INRA possède 1500 variétés de pommiers, mais pour ne pas propager de maladies, on ne peut pas sortir de matériel frais du Conservatoire.
Verger des Croqueurs de pommes de l'Anjou à Saint-Sylvain d'Anjou : "verger de sauvegarde" de 4 parcelles distinctes où sont cultivées près de 325 variétés de poiriers et 290 de pommiers . (chaque variété est cultivée en double soit environ 1200 arbres). [Liste des pommiers, Liste des poiriers, Les poiriers angevins, Les pommiers angevins Plan et accès, Calendrier des activités, Contact]
Verger Conservatoire de Pétré (LEGTA de Luçon-Pétré en Vendée) : culture et valorisation de variétés anciennes de pommes et poires PDF (280 variétés de pommes et 180 variétés de poires issues du Centre Ouest Atlantique, variétés reconnues et décrites par l'INRA. Depuis 2013, un essai mycorhization a été mis en place. Liste des variétés
Contacts-partenariatà l'INRA d'Angers ( Institut De Recherche En Horticulture Et Semences), il y a plusieurs pôles dont :
thèse 2015: «Localisation de régions du génome du pommier contrôlant la variation de caractères de qualité du fruit et de résistance aux maladies : signatures de sélection et génétique d’association» de Diane LEFORESTIER soutenue en 2015, encadrée par Charles-Eric DUREL
projet génome à l'écolePour les pommiers et les poiriers, il n'y a pas d'amorces de PCR prédéfines. Vous devez .
Vous pouvez associer des dosages à l'étude génétique.
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