Faire un TP sur Lotka Volterra avec Python
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Voici un Notebook alliant du texte et des images (imprimable en PDF) et du code exécutable, afin que les étudiants puissent modifier librement des paramètres. Ce notebook a été écrit par Olivier Ricou del'EPITA, et je l'ai modifié pour le rendre plus «biologique». Vous pouvez à votre tour le modifier.
Installez Python (par la distribution Anaconda) puis ouvrez le navigateur Anaconda pour Lancer Jupyter Notebook. |
stratégie r ou k?
Manchots empereurs d’Antarctique (Aptenodytes forsteri)
S'arrêter à 7 min |
Grenouille et crapaud :
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modèles mathématiques de populations
Sylvie Méléard : mathématique du hasard et de l'évolution
début : prédiction de l'extinction d'une population selon sa fertilité
35 min modèle de Fischer pour prédire les fréquences alléliques (comme en TP2)
39 min modèle de Wright-Fisher de dérive génétique dans une petite population de taille constante (loi binomiale)
à 42 min sur grande population (infinie) et un temps long, le coalescent de Kingman retrace la généalogie des individus (1982).
46 min application pour estimer la biodiversité passée des Cétacés
47 min éco-évolution = écologie + évolution = évolution des réseaux de relations entre espèces; modèle centré sur l'individu pour les pinsons de Darwin (adaptation, compétition diversifiante)
début : prédiction de l'extinction d'une population selon sa fertilité
35 min modèle de Fischer pour prédire les fréquences alléliques (comme en TP2)
39 min modèle de Wright-Fisher de dérive génétique dans une petite population de taille constante (loi binomiale)
à 42 min sur grande population (infinie) et un temps long, le coalescent de Kingman retrace la généalogie des individus (1982).
46 min application pour estimer la biodiversité passée des Cétacés
47 min éco-évolution = écologie + évolution = évolution des réseaux de relations entre espèces; modèle centré sur l'individu pour les pinsons de Darwin (adaptation, compétition diversifiante)